姓    名: 李金宇
性    别:

 

职    称: 闽江学者特聘教授(博士生导师)
学    历: 博士
职    务:
电    话: 0591-22867607
专    业: 计算生物化学
电子邮件: j.li@fzu.edu.cn
研究方向: 计算生物化学与医药

教育工作经历
2016.03 – 至今:福州大学化学学院 福建省“闽江学者”特聘教授
2015.09 – 2015.12:德国亚琛工业大学医学院 博士后
(导师及合作者:Prof. Giulia Rossetti)
2015.01 – 2015.09:德国于利希研究中心神经科学与医药研究所 博士后
(导师及合作者:Prof. Paolo Carloni)
2011.08 – 2015.02:德国亚琛工业大学/德国模拟科学研究院 计算生物学 博士
(导师:Prof. Bernhard Luescher 和 Prof. Paolo Carloni)
2010.08 – 2011.07:荷兰阿姆斯特丹大学 化学 硕士
(导师:Prof. Francoise Delbecq 和 Prof. Paul Fleurat-Lessard)
2010.08 – 2011.07:法国里昂高等师范学院 材料科学 硕士
(导师:Prof. Francoise Delbecq 和 Prof. Paul Fleurat-Lessard)
2007.09 – 2010.07:南京工业大学 化学工程 硕士
(导师:朱小蕾教授)
2003.09 – 2007.07:南京工业大学 环境科学 学士
 

教学简介
 

科研简介
自2007年以来,一直从事计算生物化学与医药的方法学和相关应用研究。目前,主要研究方向包括:

1) 分子模拟和计算生物化学方法学开发
2) 重大疾病中新颖靶标的构象和动力学性质的理论研究,及其抑制剂的计算机辅助设计与分子改造
3) 光敏剂与蛋白质结合的多尺度研究
4) 生物大分子与功能材料相互作用的多尺度研究
5) 生物质谱环境下蛋白质结构预测方法的开发和应用
 

社会兼职
 

科研项目
现主持:
闽江学者特聘教授科研启动项目(526258),2016.04-2019.03
国家自然科学基金青年项目(21603033),2017.01-2019.12
 

代表性论文
16. J. Li, W. Lyu, G.Rossetti, A. Konijnenberg, A. Natalello, E. Ippolitti, M. Orozco, R. Grandori, P. Carloni*. Proton dynamics in protein mass spectrometry. Journal of Physical Chemistry Letter, 2017, 8, 1105.
15. J. Li, J. Vervoorts-Weber, P. Carloni, G. Rossetti, B. Lüscher. Structural prediction of the interaction of the tumor suppressor p27KIP1 with cyclin A/CDK2 identifies a novel catalytically relevant determinant. BMC Bioinformatics, 2017, 18, 15.
14. J. Chen, H. Ye, M. Zhang, J. Li, J, Liu, J. Xue. Erlotinib Analogue‐substituted Zinc(II) Phthalocyanines for Small Molecular Target‐based Photodynamic Cancer Therapy. Chinese Journal of Chemistry, 2016, 34, 10.
13. D. Fahrenkamp#, J. Li#, S. Ernst, H. Schmitz-Van de Leur, N. Chatain, A. Kuster, S. Koschmieder, B. Lüscher, G. Rossetti, G. Muller-Newen. Intramolecular hydrophobic interactions are critical mediators of STAT5 dimerization. Scientific Reports, 2016, 6, 35454. (#contributed equally)
12. J. Li, C. Santambrogio, S. Brocca, G. Rossetti, P. Carloni, R. Grandori. Conformational effects in protein electrospray-ionization mass spectrometry. Mass Spectrometry Reviews, 2016, 35, 111.
11. J. Li, L. Jiang, X. Zhu. Computational studies of the binding mechanisms of fullerenes to human serum albumin. Journal of Molecular Modeling, 2015, 21, 2728.
10. J. Li, F. Flick, P. Carloni, B. Lüscher, G. Rossetti. Insight into the mechanism of intramolecular inhibition of the catalytic activity of sirtuin 2. PLoS ONE, 2015, 10, e0139095.
9. A. D’Urzo, A. Konijnenberg, G. Rossetti, J. Habchi, J. Li, P. Carloni, F. Sobott, S. Longhi, R. Grandori. Molecular basis for structural heterogeneity of an intrinsically disordered protein bound to a partner by combined ESI-IM-MS and modeling. Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 2015, 26, 472.
8. J. Li, G. Rossetti, J. Dreyer, S. Raugei, E. Ippoliti, B. Lüscher, P. Carloni. Molecular simulation-based structural prediction of protein complexes in mass spectrometry: The human insulin dimer. PLoS Computational Biology, 2014, 10, e1003838.
7. J. Li, P. Fleurat-Lessard, F. Zaera, F. Delbecq. Mechanistic investigation of the cis/trans isomerization of 2-butene on Pt(111): DFT study of the influence of the hydrogen coverage. Journal of Catalysis, 2014, 311, 190.
6. R. Shi, J. Li, X. Cao, X. Zhu, X. Lu. Exploration of the binding of proton pump inhibitors to human P450 2C9 based on docking and molecular dynamics simulation, Journal of Molecular Modeling, 2011,17, 1941.
5. J. Li, X. Zhu, C. Yang, R. Shi. Exploration of the binding of benzimidazole-biphenyl derivatives to hemoglobin using docking and molecular dynamics simulation, International Journal of Biological Macromolecules, 2011, 48, 20.
4. C. Yang, X. Zhu, J. Li, R. Shi. Exploration of the mechanism for LPFFD inhibiting the formation of β-sheet conformation of Aβ(1-42) in water, Journal of Molecular Modeling, 2010, 16, 813.
3. J. Li, X. Zhu, C. Yang, R. Shi. Characterization of the binding of angiotensin II receptor blockers to human serum albumin using docking and molecular dynamics simulation, Journal of Molecular Modeling, 2010, 16, 789.
2. C. Yang, X. Zhu, J. Li, K. Chen. Molecular dynamics simulation study on conformational behavior of Aβ(1–40) and Aβ(1–42) in water and methanol, Journal of Molecular Structure: THEOCHEM, 2009, 907, 51.
1. C. Yang, J. Li, Y. Li, X. Zhu. The effect of solvents on the conformations of Amyloid β-peptide (1–42) studied by molecular dynamics simulation, Journal of Molecular Structure: THEOCHEM, 2009, 895, 1.
 

获奖情况
2010 欧盟委员会伊拉斯莫斯奖学金 

其他
 课题组与德国于利希研究中心(http://www.fz-juelich.de/ias/ias-5/EN/Home/home_node.html)和德国模拟科学研究院(http://www.grs-sim.de/)长期合作,联合培养博士生,并支持优秀的硕士生、博士生和博士后赴德交流学习,欢迎有志从事计算生物医药研究的同学与我们联系。

中德博士后交流项目(德国于利希研究中心)请详见:
http://www.chinapostdoctor.org.cn/WebSite/program/Info_Show.aspx?InfoID=05cad220-0da6-428b-a9bf-c778977609d1
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